Un mystère plane autour de la genèse de la communauté Saint-Martin. Resté à sa tête de la création en 1976 à 2004, un an avant sa mort, l’abbé Jean-François Guérin a laissé peu de traces : ni livres ni mémoires
Jean-François Guérin naît en 1929 dans la petite ville de Loches, en Indre-et-Loire, dans une famille de charcutiers. Jeune séminariste brillant, diplômé d’une licence de théologie à l’université pontificale grégorienne de Rome, il est ordonné prêtre en 1955. Il est tour à tour vicaire à la cathédrale et aumônier en lycée public. Lorsque vient le concile Vatican II (1962-1965), qui réforme la liturgie de l’Église catholique et reconnaît la liberté religieuse, il entre en conflit avec l’archevêque de Tours, Mgr Louis Ferrand. « Il s’est frité avec son évêque, qui était à fond pour l’Action catholique ouvrière à l’époque », affirme le père Florian. Créée en 1950, l’Action catholique ouvrière s’inscrit plutôt dans le pôle de gauche de l’Église. L’abbé Guérin, lui, est à l’autre bout du spectre.
Il mène la fronde avec un autre abbé du diocèse, Charles Eynard de Monteynard. Quand ce dernier décide de partir pour Paris, il lui adresse, à sa messe de départ, une tirade qui restera mythique dans la future communauté : « Monsieur l’Abbé, ne vous inquiétez pas. On vous demande d’être dans le courant. Mais dans le courant, il n’y a que des épaves. » En 1965, l’abbé Guérin le rejoint dans la capitale, afin d’étudier le droit canonique. Il est accueilli au Sacré-Cœur par Mgr Maxime Charles, recteur de la basilique. Comme lui, le prélat est conservateur sans être opposé au concile Vatican II.
Confessant beaucoup de jeunes, l’abbé décide de monter un petit groupe d’étudiants, qu’il réunit chaque dimanche à la chapelle des sœurs du Bon Secours, dans le VIe arrondissement. En référence à l’un des premiers évêques de Tours, le groupe prend le nom de Saint-Martin. « Nous étions pas mal d’étudiants du Quartier latin à venir assister à ses messes », se souvient Mgr Jean-Marie Le Gall, alors élève à Science-Po et future figure de la communauté.